【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★]

1 ：田杉山脈 ★：2020/07/06(月) 21:50:34 ID:CAP_USER.net

理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

　奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

　さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

370 ：大島栄城 ：2020/07/12(日) 14:21:52.71 ID:vx7miNhr.net

俺もウサギにされたのかもしれないが

イギリスのアホくらいだろ、ウイルスでウサギ全滅させたのも

それでも中国共産党の中国人は問題だ

イギリスのアホが武漢ウイルスの感染騒ぎの大元でも

371 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:36:06.04 ID:STrc4n77.net

>>368 エボラ治療薬の事か？　エボラ治療薬はことごとく全世界で治験をやってるよ。　イベルメクチンもエボラ治療薬としてタイか何処かで治験したがエボラには余り効果がなかった。

372 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:48:36.69 ID:ezfPsc1k.net

さて、この記事を最初から最後までよーく読んでみよう！！
要するにだな

まだ「富岳」は使って無いってことだ

WWWWW
スパコンなんか使うだけ余計なんだよw

373 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:51:59.18 ID:ezfPsc1k.net

理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授

ポスドク正規研究職員の肩書は長い
定年まで国家公務員の高給もらい続けるんだから箔付けは大事w

374 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:57:10.21 ID:ezfPsc1k.net

常温核融合みたいなもんだな
こんなことやってる間に
もっと簡単な方法で新型コロナの薬はみつかるよ

これで無いことは確かだと思うw

375 ：大島栄城 ：2020/07/12(日) 14:58:16.21 ID:vx7miNhr.net

いきなり利害関係で死人が出るようなヤクをする必要があったのか、なんともいえん

376 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:00:26.14 ID:STrc4n77.net

>>372 何を読んでるんだよ

377 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:01:34.92 ID:ezfPsc1k.net

羽田から成田まで国際線で世界一周して行くようなもの

378 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:03:17.16 ID:q0Q8zP0i.net

2位じゃ無理だったなw
R4

379 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:14:30.01 ID:smJF60c7.net

>>376
https://i.imgur.com/Rw22c7r.jpg

380 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:15:39.04 ID:ezfPsc1k.net

独裁国家の将軍様みたいな書き方だね「富岳」ww

381 ：大島栄城 ：2020/07/12(日) 15:16:39.75 ID:vx7miNhr.net

韓国人の馬鹿は、アメリカ民主党のメディアミックス真似して

売るものもないのに馬鹿な宣伝やめろよ、おまえら存在してるみんなに迷惑なんだよ

俺と違って

382 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:20:23.68 ID:2PPqyOPY.net

>>1
まじで！？
満員電車で感染するってデータ出したのも富岳だっけ？
期待しちゃう

383 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 17:34:08.83 ID:STrc4n77.net

富嶽三十六景、富嶽百景
富岳36京、富岳100K

京の100倍は悲願だったんだろうな。　ほぼ、達成されつつあるようだか

384 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 21:33:11.44 ID:k7K8Bj0S.net

次の絞り込みはいつかな？

385 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 23:54:27.28 ID:BkVDxhVC.net

すごいことだね

386 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 23:55:15.18 ID:wLu1kwmg.net

能書きはいいからさっさと治療薬開発してみせろよ。

387 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 00:12:58.50 ID:DTnFWLtl.net

スパコン『AIには負けていられませんわ』

388 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 00:25:43.09 ID:/pIVEZuN.net

>>1
で？、その後富岳の仕事あるのか？

389 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 06:01:46 ID:pRpKFytO.net

>>366
ステロイド系抗炎症剤デキサメタゾンは、重症患者の致死率が3割下がったそうだな。
32位のスパコンしか持たないイギリスに、世界一の富岳が実力を見せつけるだろう。

390 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 11:26:26 ID:g9HNFAa5.net

上位の薬を発表しないのは、関係者が該当製薬会社の株を買ってるから？

391 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 13:14:51.18 ID:vTIXxMeT.net

>>382
満員電車で感染するくらい俺の頭でもわかる。

392 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 14:08:52 ID:gXsYAkqI.net

>>388
富士通の寿命がわかる

393 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 14:16:26 ID:9ynkteZ2.net

>>353
末路

キチゲェこじらせ過ぎ

394 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 14:53:58.40 ID:ka3cXcBw.net

>>391

定性的な話と定量的な評価との違いがわからない人が多すぎるな。日本は大丈夫なのか？

395 ：きぬさや：2020/07/13(月) 16:42:41.49 ID:Sfp9rTlsp

いやいや、たんぱく質は洗剤でも分解出来るんだが
体に入り込んだ時点でどの程度の発症スピードがあるかが問題であり…🦑

396 ：きぬさや：2020/07/13(月) 16:43:56.87 ID:Sfp9rTlsp

さっきのロシア語の富士バー
ってのは富士通バーカ！って事か💩。

397 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 18:55:40.29 ID:T0AixKum.net

小手先の計算をするよりまずはこいつが吐くデータが正しい事の証明する事の方が先だろう
先代の京なんてバグが見つかって今までの計算結果が全くあてにならないって事になって表沙汰になる前にあわてて破壊してなかったことにしたからな

398 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 19:20:21.19 ID:DVhLpG1Y.net

>>75
使いこなせる奴がいない

399 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 20:11:46.21 ID:TXf7h5ec.net

>>183
おめえ日本語読めねぇんか？

400 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 05:57:52 ID:MNczSncZ.net

>>387
富嶽はAI性能も測っとるよ

>>397
またポエム

401 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 08:31:10.19 ID:QdGw+fdy.net

その短期間で膨大なデータ入力なりＤＢ変換なり押し付けられた人間が居るんでしょうね。。

402 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 10:27:27.89 ID:ZIEoTev0.net

>>401

何年も前から、理研や他の団体、世界各地で、化合物データベース、特に創薬に使う化合物データベースを構築してきたので、それと1月か2月頃に解析された新型コロナの分子構造とを、マッチングしたんじゃないかな。分子動力学計算というめちゃ面倒な計算で。

403 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 10:40:31.29 ID:x0O4CvTw.net

政治も行政も任せようよ

404 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 12:34:26 ID:ZIEoTev0.net

>>403

マジレスすると、
スパコンなので、それを計算するための計算式あるいは計算アルゴリズムを提示ください。

これが難しいのよね。

AIだと、教師データと称する学習用のデータを最低でも100万パターンご用意くださいになるしね。

AIはこれが大変なのよね。

405 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 16:16:21.08 ID:m6g5/aOn.net

今は論文の自動収集で学習して行くから手間いらず。

406 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 17:04:59.46 ID:hgz4Bdqs.net

つでに発生源とコロナの開発者も探して貰えば？

407 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 17:34:10.99 ID:MNczSncZ.net

日本のスパコンの話題になると糖質発狂して、妄想を開陳してまで非難するのが数人いるんだな

その意味でやべーよスパコンw
白装束の電波※みたいに妄想家を吸い寄せてんだな

※パナウェーブ研究所

408 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 19:00:01.08 ID:ZIEoTev0.net

>>405

政治や行政の論文を読み込ませて、安倍の次は誰？を求めるのかな？

面白いかも。

409 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/15(水) 19:22:51.05 ID:0WrHawgT.net

天皇も富嶽で

410 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/15(水) 21:36:20.85 ID:sREvXxnP.net

>>409
>>407

411 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/17(金) 17:16:02.67 ID:cTXMQXml.net

計算機で判定することは簡単にできる
それが役に立ってはじめで
コンピュータ自体にも価値があるということになるのではないだろうか

412 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/18(土) 18:31:26.26 ID:jAhe8OTy.net

簡単？

413 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/19(日) 16:07:04.49 ID:KiZ7q+Re.net

各社シミュレーションに使ってるじゃん
夢の世界で生きてんのか？

414 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/21(火) 05:24:47.91 ID:nXI20ApR.net

ARMのライセンス料金を4倍にしてもうまくいくという計算もシミュレーションするといい

415 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/21(火) 17:01:34.61 ID:OE4D8krO.net

ただし結果は発表できない！
ええぇ……

416 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/24(金) 17:11:23.33 ID:ma8HmPjz.net

>>1
10日もかかった挙げ句に絞りきれず2000種類、それも「候補」とかもうね…

417 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/25(土) 16:52:30.93 ID:s9iiFxwH.net

さあ、2000人の志願者募集だ

418 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/30(木) 12:38:18.23 ID:FeG20W6P.net

宝くじの発行枚数数億枚
2000枚の中に当たり券がある
1枚300円として、60万
悪くはない

419 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/31(金) 15:57:14.45 ID:eTihSzgH.net

>>5
短小