【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★]

1 ：田杉山脈 ★：2020/07/06(月) 21:50:34 ID:CAP_USER.net

理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

　奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

　さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

83 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:14:38 ID:8tR2gviP.net

>>1
２０００の中にはサトウの水虫薬とか大正製薬のリアップも入ってるのかな？

84 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:14:45 ID:FxLU7vxT.net

2000種類って選別されとらんやんけw

85 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:17:49 ID:wR2xIpx9.net

リケンのわかめ

86 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:18:08.15 ID:PTPoUQMz.net

2000は多いな
ここからどうやって効果がありそうなやつを絞っていくんだ？

87 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:18:53.03 ID:MR51hR02.net

フロンティオがやばいな
富岳より先にAIを活用して既存の薬からコロナに効果ある薬を選別する事業始めてたのに
明日暴落不可避

88 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:20:25.94 ID:MR51hR02.net

>>41
別に富岳でなくてもできる
上場企業がすでに同じことしてるし
ただ処理能力高いから他よりもはやくできる

89 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:21:49.90 ID:jdYw5baS.net

本当に良かった　民主系が内閣じゃなくて

90 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:23:07.31 ID:1pJpeCP3.net

陰キャから嫌われるのは確かだがこういうのは実際には陽キャ特有の潤沢な行動回数使って片手間でも色んな作品見てイベントとか行って「オタク」ってアイデンティティーにすがるしかないそこいらの無気力陰キャよりはオタクやれてるんだよなぁ

91 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:26:15.23 ID:NZV2j8Pk.net

　今日本にある承認済みの薬剤を、標的のタンパク化合物にどう作用するかのシミュレーションできるソフトが、とっくの昔に完成していたのが驚き。

92 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:30:22.33 ID:1E8UAD1S.net

いま臨床試験とかやってる薬の効果確認に先に使えよって思うけど

93 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:30:51.95 ID:8O+5xJVB.net

よくわからんけど
シミュレーションソフト作る人もすごくない？

94 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:36:55.65 ID:5HK9CnXr.net

富士通χだな

95 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:38:50.09 ID:V2m8qVTn.net

>>24
富岳たんが使うわけじゃないから、適当かと。

96 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:40:20.58 ID:9TtGAbOd.net

絵に描いた餅か。

やはり無駄遣いだな。

97 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:42:49.38 ID:TdVMFCAM.net

暫くはコロナ薬開発専用機として使った方が世の中の為になるだろうからそれで行って欲しいな。

98 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:44:47.42 ID:0nDwEj8L.net

すげーーーーーーーーーな



日本

99 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:46:56.90 ID:DdWgoafx.net

イベルメクチンだろ
さっさと発表しろ

100 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:52:55.57 ID:WZvDqMnF.net

韓中米はすでに量子コンピュータ競争なのに日本はいつも周回遅れだね。

101 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:52:57.79 ID:RUn8iuSY.net

その中から選別するのが大変なのにw

102 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:55:20.31 ID:WIEar2rE.net

二位でも計算できるっしょ

103 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/06(月) 23:58:06.76 ID:r8l1tqa5.net

これでエバークエストもサクサクね

104 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:01:39.12 ID:tC0tUrTB.net

すごいね、どんな処理してるんだろ

105 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:06:50.38 ID:C4QqHp/G.net

2000は既知の組成解析済みで、そういう薬のデータベースに登録されているものですよね。

その2000の薬に対して、物理的に、原子的に新型コロナとくっつきやすいものを、分子動力学計算を使って、数個選び出したと言っているのかと。

106 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:09:53.88 ID:ZYLnCJin.net

イベルメクチンとBCG の治験を急げ

107 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:14:18.05 ID:avQJvaRw.net

>>32
かっこいい

108 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:16:47.72 ID:mWJM7j3Z.net

すごいかどうかは、最良なものを洩らず選別できていたかがわかってからでしょ。
むやみやたらとホルホルやってるほんとあの国みたいでみじめ

109 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:19:04.59 ID:ZYLnCJin.net

ニンニクと生姜が抜けてたな。

110 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:21:50.78 ID:/PM2tRt5.net

なるほど！
こういう事が出来る事が蓮舫的には嫌だったのねｗ

111 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:28:54.13 ID:B+uwGM2f.net

>>5
新薬開発の話なんだから
２０００種類なんぞ多くもなんともねぇぞ

昔は、数万種に及ぶ候補を手作業してたんだから。

今の創薬なんて、お任せモードみたいなもんだよ。

112 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:30:21.97 ID:dZiGK4I6.net

ホルホル良いっすか？

113 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:30:36.36 ID:B+uwGM2f.net

>>110
嫌も何も、チューニングだろ
そんなの２位でも別にできるけどな。
やることが別段変わる訳じゃないからｗ

114 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:31:49.30 ID:mWJM7j3Z.net

バカウヨ：選別したんだ、すごーい！！！
普通の人：間違いなく選別できたのならすごいね
でもそれはまだわからないね

この違いｗｗｗ

115 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:33:35.83 ID:cgE0rnaQ.net

>>68
神様にでも頼めよ

116 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:36:25.65 ID:1hVDcRip.net

せっかく見つけても、厚労省は利権・天下りにつながる治療薬しか認可しません

117 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:38:42.79 ID:e+QdFdgx.net

>>42
複垢して大量のやられ役作って倒してけばものすごい強くならんか？

118 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:42:01.25 ID:ZYLnCJin.net

偉い人すごく加速されたね。　流石

119 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:42:22.46 ID:GqbKvHfN.net

なんでもええわ
はよ使え

120 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:48:19.52 ID:8Tf6w3ot.net

2種類じゃダメなんですか

121 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 00:48:30.97 ID:nyVpt9k/.net

STAP細亡の 候補も
あっという間に2000個くらい
リストアップしたという

122 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:00:28.70 ID:QGfDxC+E.net

蓮舫工作員はどうしてるん？

123 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:00:57.99 ID:B+uwGM2f.net

>>120
多剤併用は複雑化しますんでｗ
種類が少ないに越したことはないですｗ

124 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:01:33.55 ID:qbeGI6gQ.net

低能だろそんな無駄なことに
何千億つっこんでないで
アビガンはよ承認しろよ

125 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:04:59 ID:GCmgVLVL.net

これが1位の実力
2位だと3倍の日数を要する

126 ：<丶｀∀´>（´・ω・｀）（｀ハ´　 ）：2020/07/07(火) 01:07:36.75 ID:S4WdI6TI.net

すごい　wonderful　快挙　
世界no1ですからね
二番ではだめですね

127 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:08:03.38 ID:c/92je2C.net

人工人間を電脳空間上で治験できるとかなら別だろうけど
結局ただのおもちゃ

128 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:10:50.35 ID:6BQ5AvBP.net

蓮舫や反日議員たちは、日本の力を減衰させるのが仕事なんだよ
中国共産党の命令でね

129 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:11:35.03 ID:LgP821pn.net

すんごいな！
活躍してくださーい！！

130 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:12:17.26 ID:Cg9t/lcT.net

armソフトバンク大勝利

131 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:12:49.93 ID:ZYLnCJin.net

>>124 アビガンなんて何も効き目はないんだから、諦めろ。アホラシ。

イベルメクチンしかないよ。

132 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:18:18.62 ID:yh/B1Z5F.net

>>128
IR誘致で中華企業から献金受けてた反日政治家がいましたね

133 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:29:47.93 ID:qbeGI6gQ.net

>>131
お前のは人間以外の生き物か？

中国、ロシア、インドetcで
アビガン一押しで開発しとるわ

人間以外の生き物なら
人間が天敵なので
アビガン承認したくない
気持ちもわかるわ

134 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:30:37.49 ID:J328koZy.net

>>124
そんな胡散臭い薬承認されても低能しか使わないよ

135 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:31:31.95 ID:oj/Xh/A/.net

>>126
こういう用途に使える汎用性が国策スパコンの条件になったのは、蓮舫の事業仕分けがきっかけなんだけど？

136 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:50:56.96 ID:9/ej4vKZ.net

スパコンが忖度しててワロタぶっ壊せ！

137 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:55:12.26 ID:ZYLnCJin.net

>>135 蓮舫さえ居なければ今頃倍の性能のスパコンを作れてたのにな。

138 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 01:56:18.79 ID:BuD292YE.net

>>1
二重国籍じゃだめなんですか？

139 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:01:48.18 ID:C4QqHp/G.net

蓮舫なんかなんも貢献してないって

140 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:03:41.11 ID:VxZx5FhZ.net

世界中でスパコン作れるのは、日米2カ国しかないから
負けても2位なんだよな

141 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:10:52 ID:C4QqHp/G.net

>>140

あと、中国。

米中は、同時に2〜3台開発できる力があるので、２位とは限らない。

LinpackベンチマークのTop500は、すぐに抜かれるかもしれないが、四冠同時にトップを取るマシンが次にすぐに出てこれるか、注目に値する。

142 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:37:51.01 ID:vpp82MoE.net

治験にはカネも時間もかかるのに、２０００種類とかバカかとｗ

ズバリの物を出してこなかったら意味がない
せいぜい１０種類にまで厳選する能力がなければな
（スパコンが２０００種類の治験をやれと人間に要求するのかよｗ何様ｗ）

ハッキリ言って、スパコンで「ヘタな鉄砲数うちゃ当たるかも？」レベルじゃ
お話にならない　カネの無駄
スパコンで治験しろよｗと言いたくなるわ

143 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:39:17.84 ID:vpp82MoE.net

ああ、副作用の可能性もスパコンで予測するんだぞ？

その程度できないようでは、膨大な電力かけてまでやる意味がない

144 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:41:21.35 ID:o6IdrFuc.net

>>142
2000種類に絞ったんじゃなくて、2000種類の中から数十種類に絞ったんだよ

145 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:48:40.08 ID:2t/rCsxN.net

>>140
来年にはアメリカ様に何倍もブチ抜かれる

日本
富岳 ARM 400ペタ 富士通製 2020年

アメリカ
Aurora x86 1000ペタ インテル製 2021年
Frontier x86 1500ペタ AMD製 2021年
El Capitan x86 2000ペタ AMD製 2023年

146 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 02:59:38 ID:Dkt3djuZ.net

>>40
この場合については良く分からないが
少なくとも個人消費データについては同意する

147 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:00:21 ID:ZBXAwZEz.net

>>3
富岳「ソシャゲはやめなさい」

148 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:02:19 ID:Dkt3djuZ.net

いくら候補が見つかってもアビガンと同じ運命なんだろ

149 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:04:33 ID:vpp82MoE.net

>>144
数十・・・ｗ　十数じゃなくてかｗ

まだ多いわｗ
危機のさなかに、そんな数を提案されてもどうすんのかとｗ

治験にかかる日数度外視してんのかね？

当るも八卦、当たらぬも八卦かよｗ
当った頃には人口激減、世界経済規模大シュリンクで文明維持もままならぬかもな
（スパコンも死ぬｗ）

150 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:19:19.48 ID:rGlBz79G.net

>>149
10000人で治験すれば良いじゃん。

151 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:20:41.48 ID:vpp82MoE.net

スパコンの中で仮想的に人体モデル作って感染させて
その治療薬候補ってのを投与して治験させろよｗ

今のスパコンは計算速度が速いだけで予め与えられたファクターに基づいて
ピックアップしてるだけじゃねーかｗ

治験に膨大な時間がかかるんだから、その間に時間かけてオタクのラップトップで
ちまちまリストアップしても一緒ｗ

開発に数千億円かける意味あんの？ｗ　
いやスパコン目的は新薬候補探すことじゃなくて円周率計算することですからｗｗｗｗてか？

それとも投入額がまだ足りないのか？使えるまで１兆円？1京円？
無駄なことだな・・ｗ

152 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:23:48.58 ID:vpp82MoE.net

>>150
そんな話なら、日本中のラップトップで、分担して与えられた範囲の中から
計算すればいいってことになるんだが？

数千億円投資の意味あんの？　
日本スゲーって勝ち誇って余韻に浸るだけで数千億円と、瞬間的に膨大な電力使うのに見合ってるか？

経済合理性がないよな・・ｗ

153 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:28:01.76 ID:vpp82MoE.net

ここＢＩＺだから世界のパソコン年間出荷台数知ってるよなぁ？

年間２億〜３億台が出荷される（スマホなども加えたデバイスでいえば２３億台）わけだが、既存のパソコンも加えて
新薬候補を分担して、与えられたファクターに基づいて計算するだけのことが
できないとでも？ｗ

笑かすわｗ

154 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 03:46:21 ID:viOdHDTL.net

いや、もっと絞れよｗ

155 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 04:13:24 ID:bBSgY96d.net

こいつ使って証券取引して国家予算増やしてくれ

156 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 04:17:04 ID:Ubohig5Q.net

その2000の中から２〜３種類に絞らないと意味ないじゃん馬鹿なの富岳って

157 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 04:17:34 ID:ZhiAbM1H.net

どうせ富士通にとって都合がいい選別基準なんでしょｗ

158 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 05:00:30.58 ID:mWJM7j3Z.net

田宮さん：犯人は「内部、もしくは外部の者の犯行」
「犯人は男性といわれているが、女性である可能性も否定できない」

富岳：コロナ治療薬は「この中のどれか、もしくはその他」
「治療薬は絞り込んでいいるが、絞り込めていない可能性も否定できない」

ホルホルバカ：すごーい！！！

ホルホルやってるやつらってほんと恥ずかしいよなｗ

159 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 05:28:26.62 ID:ZhiAbM1H.net

どんな生き方してきたら富士通製のスパコンを信用できるんだろう…

160 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 05:35:02.91 ID:LbOFJXsz.net

村井ワクチンは効く、
アビガンは効く、
どちらも認証しない

161 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 05:37:59.96 ID:SZc8DKyq.net

必死に否定している奴らの惨めさったらないわな

162 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 07:05:14.12 ID:Cf5cFn0P.net

治験か

163 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 07:39:05.79 ID:ZzcGXsdd.net

絞り込むのか、さらに範囲を広げるのかどっちだろう？

164 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 09:06:59.36 ID:0aiUe5Iq.net

タンパク質の第一原理計算したい

165 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 09:08:14.05 ID:vpp82MoE.net

計算つか、膨大な資料から特定の単語を拾って検索してるだけじゃね・・・ｗ

数千億円かけて計算以下の仕事でジコマンか？

166 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 09:26:32.18 ID:C4QqHp/G.net

>>165

分子動力学計算。

167 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 09:41:49.74 ID:yulBZlbJ.net

ここだけの話だけど
スパコンで人間は年内に絶滅すると計算されたらしいね

168 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 09:43:44.91 ID:f9CU5gWA.net

髪の毛が生える薬の開発を頼む(´；ω；`)

169 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 09:56:51 ID:U5L2eGLQ.net

>>1
大戦略IIの１ターンがどのぐらいで終わるのか
試させてほしい

170 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 10:20:05.63 ID:o+lq4H/y.net

ウィルスを追撃して殺すタンパク質まだ？

171 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 10:47:50.09 ID:ZYLnCJin.net

>>141 GPU方式ではGraph500 は無理だよ。
Graph500 とHPCG500 はしばらく抜かれないだろう。

172 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 11:01:38 ID:ZYLnCJin.net

>>152 あほ、その方が電力食うぞ。

173 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 11:07:27 ID:ZYLnCJin.net

>>156 馬鹿は黙っとれ、薬というのはいろんな効果があるから1種類で万能薬なんて存在せん。

熱さまし、ウイルスを殺す、ウイルスの侵入を防止する、ウイルスが増えるのを防ぐ、血栓防止、肺炎防止、サイトカイン暴走防止、、、、免疫強化
これらだけでも何十となる。

174 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 11:14:33 ID:33mu9bNg.net

ちょっとずれた話かもしれんけど、むかしむかし、世界中の人たちのPCに協力してもらって
ガン治療の成果を出そうとかってなかったっけか？
ああいうの今でもやってんの？

175 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 11:39:07 ID:F4/t5VXi.net

これは別に2位のスパコンにやらせても問題ない案件

176 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 11:47:01.10 ID:NXNpKKfh.net

これ自体はいい事だが、2位でもできることだな
使い勝手の方が大事だろ
その点で富嶽は優れてるんだろうが
富嶽の結果で京が正しかったって言う理屈がわからん

177 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:07:30.59 ID:HvIiz+Dq.net

10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別
富岳じゃなきゃってほどでもないね

178 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:20:08.11 ID:KGYQPw0U.net

>>175
コロナで世の中大変なのに？

179 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:22:46.46 ID:HLFgKJOQ.net

2000種類からどう絞り込むんだろ？
コロナ感染のラットに投与->健康な人間に投与->コロナ感染の人間に投与 かな？

180 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:30:21.70 ID:1sebdy0B.net

>>5
2000を更に優劣付けられないととても試験まで進めないな…

181 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:33:17.98 ID:L52S3uFM.net

(´・ω・｀)もう絞り込んでいるそうな、特許切れてる薬とか数種類候補があって
今発表すると大変な騒ぎになるから発表を控えているけど、国内の某有名製薬会社と共同研究をするらしい
数ヶ月のうちに、その某製薬会社の株価が暴騰するから、楽しみにみててみ

182 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:40:32.29 ID:xurVy3HD.net

folding@homeとはなんだったのか・・

183 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/07(火) 12:54:04.04 ID:LcbCFOSq.net

>>18
いや既存薬の転用だからほぼ薬効の確認
だけだからそんなに時間はかからない。