【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★]

1 ：田杉山脈 ★：2020/07/06(月) 21:50:34 ID:CAP_USER.net

理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

　奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

　さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

319 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/08(水) 21:50:56.03 ID:UJSuSbwb.net

そんなに高性能なら給付金の受付サーバに使えばよかったのに

320 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/08(水) 22:17:18.06 ID:l9VmGowN.net

>>309
成果から目をそらしつつ書いてるのかな

321 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/08(水) 22:21:26.81 ID:l9VmGowN.net

>>318
分子動力学とはそういうもん

本件は生化学分野だけど、コンピューターによる化学反応のシミュレーションなどは、
約50年前から構想されてる

322 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 02:44:53 ID:el6hjhTT.net

>>319 手書きで人間が復唱してるから無理。

323 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 02:59:58 ID:H7sCmm64.net

日本の技術は世界一ィィイイイ

324 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 12:48:13.26 ID:+m8abaKw.net

三十六京

325 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 14:14:05.03 ID:31XDyzut.net

アビガンを富岳から評価するとどうなんの？効果あるの？

326 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 17:35:57.59 ID:+CpQtKEZ.net

多分効果無し

327 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 20:12:09.42 ID:kuwH88ZH.net

日帝の超重爆ニダ、戦犯スパコンニダ

328 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 20:20:51.52 ID:Ub83CRYu.net

>>32
逃げるに如かず

329 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 21:19:14.41 ID:m1zZ7AQG.net

漂うポンコツ臭

330 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 21:44:06 ID:mnI9Nhrp.net

>>5
シミュレーションプログラム次第だろうな

331 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 22:32:55.21 ID:5UIwCiIV.net

京が京速コンピュータと言われたんで
富岳は36京以上を目指したんだよね

332 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/09(木) 23:34:28 ID:+MYWzaJ+.net

富士通だから
親指シフトキーボードなんだろ？

333 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 01:29:03.24 ID:pVuOSsNS.net

>>331
32倍じゃないのがむず痒いな

334 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 01:53:50.68 ID:S6YIjiD5.net

富嶽三十六景　富岳36京

335 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 03:19:26 ID:LmImVMTd.net

>>326
あかんやん

336 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 06:56:37.34 ID:PVtbANrJ.net

157.245

337 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 07:02:18.80 ID:C3eVl3wu.net

これ、全然絞れてないよね

338 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 07:03:28.59 ID:C3eVl3wu.net

現実に2000種類もつくわけないのに、
non specificに2000種類も結合すると予測するなんてただのポンコツじゃん

339 ：大島栄城 ：2020/07/10(金) 07:03:41.11 ID:X+vXUyZJ.net

やめときゃいいのに、こんなときだから仕方なくだろ

絞った結果しらせたら死人が出るじゃすまないじゃん、ヤク関係

340 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 07:32:06 ID:UhAR5HQv.net

>>27
お、なんだなんだ
お前むちゃくちゃかわいそうな頭脳持ってるな
かわいそう
自覚するところから始まるからな。がんばれよ

341 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/10(金) 07:49:13 ID:duQxS8tD.net

>>338

相変わらず、ちゃんと読まずに反応する人がいるな。
誤解しやすいスレッドタイトルなのが問題なのだけど。

薬の化合物データベースに登録されている2000個の薬の中から、新型コロナウイルスと結合しやすい物を選別したですよね。

結合のしやすさは数値（スコア）で表示され、上位のものほど、有力ということだね。

342 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 01:22:24 ID:/h0BRLaJ.net

>>339
わかってねえw >>341 へ

343 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 08:03:52 ID:JdsRBenP.net

あのこのハートをディープラーニングしたい

344 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 08:37:46 ID:3XnBT88J.net

選別(2000種類超)

345 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 08:50:06 ID:FrPdfQQA.net

アビガンでも効果無いし、2000種で本当に効果あるものあるか？
まともな計算もせずに適当に薬の名前表示しただけじゃないの？

346 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 08:53:44 ID:FrPdfQQA.net

>>341
その結合しやすいっていうエビデンスは？
それに結合しやすいから効果あるっていうエビデンスも無いよね
根拠のない計算をして根拠のないスコアをあてて根拠のない選別したってこんなの何の役にも立たない糞データじゃん

347 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 09:06:54.61 ID:dq9RhYXm.net

こういう場合2000を選別とは言わない バカ記者

348 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 09:18:28 ID:aYvq+IfK.net

>>346 薬とはどんな原理で働いてるかの知識もなく馬鹿なこと言うな。

349 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 12:36:44.92 ID:SGDMLmjU.net

>>346
無知が噛み付くと惨めだなぁ

350 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 13:32:20.76 ID:/h0BRLaJ.net

>>346
分子の振る舞いが政治的思惑で決定できると信じる低能政治厨w

使えないネトウヨ・パヨクの典型じゃん

351 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 13:36:49.89 ID:/h0BRLaJ.net

追記

>>346
そんなんだから大躍進政策で餓死者が2千万人も出たんだよ

机の上でノルマ決めた途端に、現実の穀物のとれ高がアタマん中で決まる、
政治的立ち回りしかないヤツの恐ろしさよ

352 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 13:42:39.72 ID:jrgchMSu.net

選別にそんな数出たら混乱するべ

353 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 18:48:54 ID:FrPdfQQA.net

根拠のない情報に踊らされるネトウヨ発狂してワロタw
お前等が分子の働き的に効果絶大だわ日本の誇りだホルホルっていってたアビガンの末路を見ろよw

354 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 18:57:55 ID:XwWx6/Yg.net

学が無いのに自分の意見に自信を持てるって才能だと思うよ

355 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 19:43:25.25 ID:FrPdfQQA.net

コロナウィルスが学に恐れおののいて敗北を認めて消えてくれたらいいのにねw

356 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 19:52:06 ID:XwWx6/Yg.net

面白くない書き込みにずっとw付けて人生楽しいんやろなぁ

357 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 20:51:55.31 ID:FrPdfQQA.net

学歴だけしかすがる物がない今までなにも成し得てこなかった口だけの無能を煽るようなことを言ってすまない
ああいうのは無能なくせにプライドだけは一人前だから下手な事言うと寄生をあげて暴れるって聞いたことあるわ
もし発狂した無能がご近所に迷惑かけてたらこの場を借りて深く謝罪するわ

358 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/11(土) 21:05:25.65 ID:NGF2iy9s.net

早くやれ　ちゅうーんングしてやれ　そしていい結果を持って　もう一回発表しろ


富嶽富嶽って　そんなもんはツールに過ぎず　対コロナでスラ役に立つかどうかまだ不明って　何してきたんだよ


世界一がどうしても必要ですかってまた言われるぞ　証明しちまうぞ　話題の割に役立たずって


富岳用にチューニング可否って言い訳がぬるい　スパコン様さま教はいらねーから

359 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 08:21:44.41 ID:5QOW2rYW.net

数千って、いくつの種類から2000種類に絞り込んだのか？　まさか、3000とか、
4000種類から2000種類に絞り込んだとかじゃないよな?

そんな当たる確率の低い予想屋なんて、場外馬券場の素人にも相手にされんぞ。

なお、2000種類の治療薬候補からの選別は、人体実験と手作業になります。

360 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 09:18:11.43 ID:hh05gdSy.net

>>359 小学校の国語をおさらいしてから出直せ

361 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 10:15:10 ID:2haMYK0H.net

>>359

明示されたURLのソースも読まずに勘違いして書き込む人が多すぎるな。タイトルの日本語が変なせいもあるけど、読解力ない早漏の奴、多過ぎ。日本人、大丈夫かな。

日本人じゃないなら仕方がないけど。

362 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 10:17:34 ID:nbxU6xtS.net

>>359
2000から絞ると本当に評価して効く薬が一つも無いデタラメ吐いたポンコツってばれるしねぁ
同じコロナウィルスの風邪の薬は発熱押さえるとか喉の痛みを和らげる程度でまともに効く薬がないのと同じで
今更探しても効く薬がみつかる根拠なんてなにもない

363 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 11:25:44 ID:1XNZDJYk.net

記事の全文読んでみたが、すでに１０数種の候補を特定したそうだ。
その全部が世界各国で治験などが行われているらしい。つまり富岳が世界中から
探し出した薬剤が程度の差はあれ、コロナに有効だと推測されている。
富岳は早いだけのスパコンじゃないね。さすが４冠達成の、ホントに凄い機械だ。
で、気になる最もコロナに有効な薬剤が、実は日本の製薬会社が売っている既存薬で
特許も取得済みとか。ただし、その薬剤名は今の段階では公表しないという。

364 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 11:32:06 ID:k8DOEXXM.net

詳細は調べてみないとわからないが
もし加納氏のある物質ならば
今までの創薬の常識からすればこの数字はすごい

365 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 11:47:11.12 ID:hh05gdSy.net

>>363 全てで治験が行われてる訳じゃないだろ。知見が進んでいる薬も含まれてるというだけで。

今はまだ1つのタンパク質との相性を調べただけで、後2つか3つのタンパク質との相性も調べてるらしい。

366 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 13:01:16.35 ID:Fo4P41vu.net

世界一のスパコン富岳を持つ日本より先に、イギリスなどで見つかっているのはなぜ？

367 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 13:04:56.07 ID:hh05gdSy.net

>>366 何が見つかってるって？　ワクチンと薬とを混同してるだろ。

368 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 13:19:34.26 ID:Fo4P41vu.net

>>367
治療薬だよ。　そんなことも知らないの。

369 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 13:28:30.63 ID:PC1ddO+c.net

>>366
イギリスは感染者や重症者が多くて薬が試せるよな

370 ：大島栄城 ：2020/07/12(日) 14:21:52.71 ID:vx7miNhr.net

俺もウサギにされたのかもしれないが

イギリスのアホくらいだろ、ウイルスでウサギ全滅させたのも

それでも中国共産党の中国人は問題だ

イギリスのアホが武漢ウイルスの感染騒ぎの大元でも

371 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:36:06.04 ID:STrc4n77.net

>>368 エボラ治療薬の事か？　エボラ治療薬はことごとく全世界で治験をやってるよ。　イベルメクチンもエボラ治療薬としてタイか何処かで治験したがエボラには余り効果がなかった。

372 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:48:36.69 ID:ezfPsc1k.net

さて、この記事を最初から最後までよーく読んでみよう！！
要するにだな

まだ「富岳」は使って無いってことだ

WWWWW
スパコンなんか使うだけ余計なんだよw

373 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:51:59.18 ID:ezfPsc1k.net

理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授

ポスドク正規研究職員の肩書は長い
定年まで国家公務員の高給もらい続けるんだから箔付けは大事w

374 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 14:57:10.21 ID:ezfPsc1k.net

常温核融合みたいなもんだな
こんなことやってる間に
もっと簡単な方法で新型コロナの薬はみつかるよ

これで無いことは確かだと思うw

375 ：大島栄城 ：2020/07/12(日) 14:58:16.21 ID:vx7miNhr.net

いきなり利害関係で死人が出るようなヤクをする必要があったのか、なんともいえん

376 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:00:26.14 ID:STrc4n77.net

>>372 何を読んでるんだよ

377 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:01:34.92 ID:ezfPsc1k.net

羽田から成田まで国際線で世界一周して行くようなもの

378 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:03:17.16 ID:q0Q8zP0i.net

2位じゃ無理だったなw
R4

379 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:14:30.01 ID:smJF60c7.net

>>376
https://i.imgur.com/Rw22c7r.jpg

380 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:15:39.04 ID:ezfPsc1k.net

独裁国家の将軍様みたいな書き方だね「富岳」ww

381 ：大島栄城 ：2020/07/12(日) 15:16:39.75 ID:vx7miNhr.net

韓国人の馬鹿は、アメリカ民主党のメディアミックス真似して

売るものもないのに馬鹿な宣伝やめろよ、おまえら存在してるみんなに迷惑なんだよ

俺と違って

382 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 15:20:23.68 ID:2PPqyOPY.net

>>1
まじで！？
満員電車で感染するってデータ出したのも富岳だっけ？
期待しちゃう

383 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 17:34:08.83 ID:STrc4n77.net

富嶽三十六景、富嶽百景
富岳36京、富岳100K

京の100倍は悲願だったんだろうな。　ほぼ、達成されつつあるようだか

384 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 21:33:11.44 ID:k7K8Bj0S.net

次の絞り込みはいつかな？

385 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 23:54:27.28 ID:BkVDxhVC.net

すごいことだね

386 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/12(日) 23:55:15.18 ID:wLu1kwmg.net

能書きはいいからさっさと治療薬開発してみせろよ。

387 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 00:12:58.50 ID:DTnFWLtl.net

スパコン『AIには負けていられませんわ』

388 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 00:25:43.09 ID:/pIVEZuN.net

>>1
で？、その後富岳の仕事あるのか？

389 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 06:01:46 ID:pRpKFytO.net

>>366
ステロイド系抗炎症剤デキサメタゾンは、重症患者の致死率が3割下がったそうだな。
32位のスパコンしか持たないイギリスに、世界一の富岳が実力を見せつけるだろう。

390 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 11:26:26 ID:g9HNFAa5.net

上位の薬を発表しないのは、関係者が該当製薬会社の株を買ってるから？

391 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 13:14:51.18 ID:vTIXxMeT.net

>>382
満員電車で感染するくらい俺の頭でもわかる。

392 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 14:08:52 ID:gXsYAkqI.net

>>388
富士通の寿命がわかる

393 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 14:16:26 ID:9ynkteZ2.net

>>353
末路

キチゲェこじらせ過ぎ

394 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 14:53:58.40 ID:ka3cXcBw.net

>>391

定性的な話と定量的な評価との違いがわからない人が多すぎるな。日本は大丈夫なのか？

395 ：きぬさや：2020/07/13(月) 16:42:41.49 ID:Sfp9rTlsp

いやいや、たんぱく質は洗剤でも分解出来るんだが
体に入り込んだ時点でどの程度の発症スピードがあるかが問題であり…🦑

396 ：きぬさや：2020/07/13(月) 16:43:56.87 ID:Sfp9rTlsp

さっきのロシア語の富士バー
ってのは富士通バーカ！って事か💩。

397 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 18:55:40.29 ID:T0AixKum.net

小手先の計算をするよりまずはこいつが吐くデータが正しい事の証明する事の方が先だろう
先代の京なんてバグが見つかって今までの計算結果が全くあてにならないって事になって表沙汰になる前にあわてて破壊してなかったことにしたからな

398 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 19:20:21.19 ID:DVhLpG1Y.net

>>75
使いこなせる奴がいない

399 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/13(月) 20:11:46.21 ID:TXf7h5ec.net

>>183
おめえ日本語読めねぇんか？

400 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 05:57:52 ID:MNczSncZ.net

>>387
富嶽はAI性能も測っとるよ

>>397
またポエム

401 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 08:31:10.19 ID:QdGw+fdy.net

その短期間で膨大なデータ入力なりＤＢ変換なり押し付けられた人間が居るんでしょうね。。

402 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 10:27:27.89 ID:ZIEoTev0.net

>>401

何年も前から、理研や他の団体、世界各地で、化合物データベース、特に創薬に使う化合物データベースを構築してきたので、それと1月か2月頃に解析された新型コロナの分子構造とを、マッチングしたんじゃないかな。分子動力学計算というめちゃ面倒な計算で。

403 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 10:40:31.29 ID:x0O4CvTw.net

政治も行政も任せようよ

404 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 12:34:26 ID:ZIEoTev0.net

>>403

マジレスすると、
スパコンなので、それを計算するための計算式あるいは計算アルゴリズムを提示ください。

これが難しいのよね。

AIだと、教師データと称する学習用のデータを最低でも100万パターンご用意くださいになるしね。

AIはこれが大変なのよね。

405 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 16:16:21.08 ID:m6g5/aOn.net

今は論文の自動収集で学習して行くから手間いらず。

406 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 17:04:59.46 ID:hgz4Bdqs.net

つでに発生源とコロナの開発者も探して貰えば？

407 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 17:34:10.99 ID:MNczSncZ.net

日本のスパコンの話題になると糖質発狂して、妄想を開陳してまで非難するのが数人いるんだな

その意味でやべーよスパコンw
白装束の電波※みたいに妄想家を吸い寄せてんだな

※パナウェーブ研究所

408 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/14(火) 19:00:01.08 ID:ZIEoTev0.net

>>405

政治や行政の論文を読み込ませて、安倍の次は誰？を求めるのかな？

面白いかも。

409 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/15(水) 19:22:51.05 ID:0WrHawgT.net

天皇も富嶽で

410 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/15(水) 21:36:20.85 ID:sREvXxnP.net

>>409
>>407

411 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/17(金) 17:16:02.67 ID:cTXMQXml.net

計算機で判定することは簡単にできる
それが役に立ってはじめで
コンピュータ自体にも価値があるということになるのではないだろうか

412 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/18(土) 18:31:26.26 ID:jAhe8OTy.net

簡単？

413 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/19(日) 16:07:04.49 ID:KiZ7q+Re.net

各社シミュレーションに使ってるじゃん
夢の世界で生きてんのか？

414 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/21(火) 05:24:47.91 ID:nXI20ApR.net

ARMのライセンス料金を4倍にしてもうまくいくという計算もシミュレーションするといい

415 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/21(火) 17:01:34.61 ID:OE4D8krO.net

ただし結果は発表できない！
ええぇ……

416 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/24(金) 17:11:23.33 ID:ma8HmPjz.net

>>1
10日もかかった挙げ句に絞りきれず2000種類、それも「候補」とかもうね…

417 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/25(土) 16:52:30.93 ID:s9iiFxwH.net

さあ、2000人の志願者募集だ

418 ：名刺は切らしておりまして：2020/07/30(木) 12:38:18.23 ID:FeG20W6P.net

宝くじの発行枚数数億枚
2000枚の中に当たり券がある
1枚300円として、60万
悪くはない